当前，工程技术和生物科学紧密结合，推动农业可持续发展，改善二十一世纪人类生存条件，已成为国际农业工程科学技术发展的聚焦点。“农业生物环境与能源工程”学科属“农业工程”一级学科下设四个二级学科中最年轻的新兴学科。该学科是农业工程类最具工程与农业生物学结合特色的交叉学科，综合了建筑工程、机电设备、控制工程、传感技术、能源工程、流体工程及农业生物等领域的先进技术。

1978年，根据我国国情和实现农业现代化的具体要求，借鉴发达国家农业工程学科发展的经验，浙江大学继中国农业大学之后创建“农业生物环境与能源工程”学科；1990年获农业生物环境工程硕士学位授予权；1996年获第一批(两个)博士学位授予权；实验基地被命名为“农业部生态农业环境工程重点开放实验室”；2002年该实验室重新申报成功，并被评为农业部优秀实验室，是浙江省重点扶植学科。迄今已培养博士生21名，硕士生30名。

20年来本学科完成国家农业部、科技部、教育部及国家自然科学基金委员会、省市部委重要项目30余项，如： “七五”、“八五” 农业部全国重点攻关项目（无土栽培设施及配套技术；高效节能实用蔬菜无土栽培技术）；“九五”科技部国家重大科技产业工程（工厂化高效农业示范工程）、“十五”国家农业科技成果转化资金项目（系列化华东地区连栋塑料温室结构及环境调控成套装备中试）；国家自然科学基金项目5项等，获多项重大开创性成果。完成与比利时国立让布鲁农学院和鲁汶大学合作进行的五项本领域国际合作项目；比利时政府提供总研究经费近80万美元；本学科派出十五位年轻教师和在学研究生去比利时进修学习、合作研究，双方教授多次互访；鲁汶大学并派出两位专家在本学科实验室长期工作，合计达三年之久，在本学科建成“植株与水质分析实验室”及“农业建筑与动物行为生理人工气候室”两个实验室。

本学科教师队伍稳定，拥有资深教授、中青年教授博导和一批出国进修学习过的年青教师，现有教授7位，博导5位，学术功底深厚，能把握本学科的发展方向，有前瞻性。

当前本学科的研究方向为：生态农业实施与装备工程；非气物资源化与微生物环境工程；现代信息技术在农业生产中的应用；生态农业生产过程中环境检测与调控技术。